Wer schon einige Zeit mit PHP und den Einstellungen in der php.ini zu tun hat, der weiß, dass Updates immer wieder die php.ini-Datei überschreiben (wollen).
Um die Einstellungen für bspw. opcache dauerhaft zu übernehmen, bietet es sich an, die Einstellung in die jeweilige pool.d/[www].conf Datei zu übernehmen.
; opcache settings for pool.d/www.conf
php_value[opcache.enable] = 1
php_value[opcache.enable_cli] = 1
php_value[opcache.interned_strings_buffer] = 8
php_value[opcache.max_accelerated_files] = 10000
php_value[opcache.memory_consumption] = 128
php_value[opcache.save_comments] = 1
php_value[opcache.revalidate_freq] = 1